酶標儀實際上就是一臺變相的光電比色計或分光光度計，其基本工作原理與主要結構和光電比色計基本相同。光源燈發出的光波經過濾光片或單色器變成一束單色光，進入塑料微孔極中的待測標本。該單色光一部分被標本吸收，另一部分則透過標本照射到光電檢測器上，光電檢測器將這一待測標本不同而強弱不同的光信號轉換成相應的電信號。
電信號經前置放大，對數放大，模數轉換等信號處理后送入微處理器進行數據處理和計算，zui后由顯示器和打印機顯示結果。微處理機還通過控制電路控制機械驅動機構X方向和Y方向的運動來移動微孔板，從而實現自動進樣檢測過程。而另一些酶標儀則是采用手工移動微孔板進行檢測，因此省去了X,Y酶標儀方向的機械驅動機構和控制電路，從而使儀器更小巧，結構也更簡單。微孔板是一種經事先包理于放置待測樣本的透明塑料板，板上有多排大小均勻一致的小孔，孔內都包埋著相應的抗原或抗體，微孔板上每個小孔可盛放零點幾毫升的溶液。
酶標儀的功能是用來讀取酶聯免疫試劑盒的反應結果，因此要得到準確結果，試劑盒的使用必須規范。許多醫院在使用酶標儀之前是通過目測判斷結果，操作過程隨意性較大，在使用酶標儀后如果不能及時糾正操作習慣，會造成較大誤差。
在酶標儀的操作中應注意以下事項：
1、使用加液器加液，加液頭不能混用。
2、洗板要洗干凈。如果條件允許，使用洗板機洗板，避免交叉污染。
3、嚴格按照試劑盒的說明書操作，反應時間準確。
4、在測量過程中，請勿碰酶標板，以防酶標板傳送時擠傷操作人員的手。
5、請勿將樣品或試劑灑到儀器表面或內部，操作完成后請洗手。
6、如果使用的樣品或試劑具有污染性、毒性和生物學危害，請嚴格按照試
7、劑盒的操作說明，以防對操作人員造成損害。
8、如果儀器接觸過污染性或傳染性物品，請進行清洗和消毒。
9、不要在測量過程中關閉電源。
10、對于因試劑盒問題造成的測量結果的偏差，應根據實際情況及時修改參數，以達到*效果。
11、使用后蓋好防塵罩。出現技術故障時應及時與廠家，切勿擅自拆卸酶標儀。
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